1、所有的晶片都应保持清洁。若有细小灰尘，可用吹风气球吹去或棉纱轻轻抹去；若有油迹和手指印，可用蘸有少量比例为3：7的乙醇混合液的棉纱轻轻抹去。
2、不能用有机溶剂去擦拭尼康显微镜的其余表面，特别是塑料品的表面，应用中性洗涤剂进行清洁。
3、不应自行拆装显微镜，以免使显微镜性能收到影响。
4、显微镜不使用时，应用防尘罩盖好，使之不与灰尘接触，并贮藏在隔绝湿气的地方，以免生锈或发霉。
5、为保持显微镜的性能，建议进行定期检查。